После драматических потрясений в первой части Epic Mickey мир игры понемногу восстановился и зажил спокойной и даже размеренной жизнью. И тут в Пустоши начинаются странные землетрясения — за считанные секунды они обращают достопримечательности в хлам, а местных жителей повергают в панику и заставляют вспомнить о былых невзгодах.
Пока мультяшные жители околодиктаторской республики ждут от своего бессменного лидера Освальда хоть сколько-нибудь адекватных действий, в кадр, верхом на страшном роботе и во все горло распевая о счастье и цветочках, врывается Безумный доктор, обладатель самой зловещей растительности на лице за всю историю Диснея. Бывший злодей просит всех перестать паниковать, причину землетрясений он знает и вот-вот с ней разберется, а вы, друзья, пока занимайтесь своими делами и думайте о хорошем.